Полное название клуба - Футбольный Клуб «Краснодар». Основан - 2000 год

Клуб "Краснодар - 2000" образован в 1999-м году, юношеская команда региона "Кавказ", в эту команду собраны лучшие юные футболисты Краснодарского края, Адыгеи и Дагестана, велась подготовка к чемпионату России по футболу среди юношей 1984 года рождения. 

Возглавившие команду "Краснодар - 2000", председатель краевой федерации футбола Безбогин Г.К. и тренер Поскотин А.Ф. На выделенные средства команда была экипирована и смогла провести двухматчевые сборы. Это принесло положительный результат. Команда стала чемпионом России. С целью сохранения команд, краевой федерацией футбола, при поддержке Молдованова А.Б, принято решение в создать Центр подготовки юных футболистов на базе сборной региона. В кратчайшие сроки были решены все вопросы, юных футболисты получили возможность под руководством тренеров постигать азы футбола, участвовать в чемпионате Краснодарского края по футболу. В 2000-м году команда "Краснодар - 2000", назвается "Центр-Р-Кавказ", выиграла региональный турнир команд региона "Кавказ" и выступает во втором дивизионе российского чемпионата.

В конце 2000-го в "Центр-Р-Кавказ" создан футбольный клуб "Краснодар - 2000", его президентом стал Молдованов А.Б, возглавил команду "Краснодар - 2000" молодой тренер Николай Южанин. Датой рождения команды считается 25-го марта 2001-го года, "Краснодар - 2000" провел свой первый матч в Кубке России. Команде клуба "Краснодар - 2000" принадлежат и два российских рекорда, установиленные в матче с "Локомотив-Тайм" из Минеральных Вод, победа со счетом - 16:1, игрок нападения клуба "Краснодар - 2000" Игорь Киселев забил в этом матче 10 мячей.