Клуб был основан 19 Декабря 1909-м группой молодых мужчин церкви Молодой Троицы, где они играли в футбол под твердым надзором священника. Отец Девальд закрывал двери когда они  попытались сходить на организационное собрание, проходившее в местном кабаке - Zum Wildschutz.
Имя Боруссия является Латинский для Пруссии и взято из соседней пивоварни Боруссия. Команда начала играть в сине-бело полосатых рубашках с красным кушаком и черными шортами. В 1913 они изменили её на черно-желтую знакомую и сегодня.
Несколькими десятилетиями клуб наслаждался только скромными успехами, играя в местных чемпионатах. У них была в 1929 году проблема, команда чуть не обанкротилась, но сохранилась из-за щедрости местного болельщика, который покрыл долги из его собственного кармана.

В 1930-е годы, Третий Рейх захватил руководство над страной и начал перестраивать все виды спорта и футбольные клубы по всей Германии, чтобы они подходили для целей режима. Президент Боруссии был свергнут с поста, когда отказался присоединяться к нацистам и ещё несколько участников, которые тайно использовали офис клуба для производства анти-памфлет. После Второй Мировой Войны Боруссия преобразилась в игре и даже возникло клубное дерби против Шальке-04. Также в истории клуба была недолговечная попытка объединения двух других  команд Werksportgemeinschaft Hoesch и Freier Sportverein 98 и назвали этот клуб так Sportgemeinschaft Borussia von 1898, но затем переименовали в Ballspiel-Verein Borussia (BVB) так команда называется и сейчас.
Западная Оберлига, это первая лига, в которой выступала Боруссия. В 1949 достигла финала в Штутгарте против ВфР маннхейм и проиграла 2-3 в дополнительное время. Клуб выиграл первое  золото только в 1956. Годом позже повторила свой успех.  В 1963 третий титул чемпиона Германии.
В 1962 Немецкая Федерация Футбола проголосовала, за образование профессиональной футбольной лиги. Команда заработала себе место среди первых шестнадцати команд, которорые вошли в новую лигу.

В 1965 дортмундцы завоевали первый  Кубок германии. 1970-е года характеризуются финансовыми проблемами и вылетом клуба из элиты немецкого футбола, только в 1976 они вернулись обратно, но продолжали  страдать финансовыми проблемами до начала 1980-х годов.
В 1993 год значится выходом в финал кубка УЕФА, против итальянского Ювентуса, 1-6 в пользу Юве закончился матч. Несмотря на этот результат Боруссия получила уйму денег, на которые были приобретены игроки. Прошло два года и Дортмунд возвысился во главе турнирной таблицы Бундеслиги, впоследствии став чемпионом в четвёртый раз.
Особо памятен 1997 сезон, когда бросив все силы команда добирается наконец до финала Лиги Чемпионов, который проходил в Мюнхене и снова на пути стоит грозный Ювентус, за который играли такие мастера футбола как Зенедин Зидан, Алессандро Дель Пьеро и др. на этот раз даже такой звёздный состав туринце не сумел остановить Дортмунд,  3-1 победа досталась немецкому клубу. Финал Межконтинентального кубка достался немцам 2-0 в противостоянии с бразильским Крузейро  в том же году. В новом тысячелетии двумя годами позже они выигрывают Бундеслигу. В том же году снова финал Кубка УЕФА против голландского Феенорда.
Тяжёлое финансовое положение клуба вело к тяжелому бремени, долги  и аренда земли на Вэстфаленштадион, Боруссия снова обанкротилась в 2005-м.

Для того чтобы поднять капитал клуба, был переименован стадион, для проведения ЧМ-2006 года. Стадион является самым большим футбольным стадионом в Германия с возможность размещения на своих трибунах 80 720 зрители.
В течение 2008 сезон был одним из лучших в течение 20 лет, тем не менее, они достигли финала Кубка Германии против мюнхенской Баварии, где проиграли 2-1 в дополнительное время. В 2009 - 2010-м сезоне, клуб квалифицировался в Лигу Европы.
2010/11 сезон в составе клуба появилось много молодых и новых игроков, они то и будут выделять клуб на протяжении всего сезона.